משתמש:Weghit/דינמיקה מולקולרית
ויקיפדיה האנציקלופדיה encyclopedia
מולקולרית דינמיקה (MD) הוא הדמיית מחשב שיטת לימוד תנועות פיזיות של אטומים לבין מולקולות, ולכן היא סוג של N-גוף סימולציה. את האטומים ואת המולקולות הם רשאים לדבר על תקופת זמן קבועה, נותן מבט על הדינמיקה האבולוציה של המערכת. ב-הגרסה הנפוצה ביותר, את המסלולים של אטומים ומולקולות נקבעים על ידי מספרית פתרון של ניוטון משוואות התנועה עבור מערכת של אינטראקציה חלקיקים, שבו כוחות בין החלקיקים שלהם פוטנציאל האנרגיות מחושבים באמצעות interatomic פוטנציאלים או מולקולרית, מכניקה שדות כוח. השיטה פותחה במקור בתוך השדה התיאורטי של הפיזיקה בסוף 1950[1][2][3] אבל מוחל היום בעיקר כימי פיזיקה, מדע החומרים ואת דוגמנות של מולקולות ביולוגיות.
כי מולקולרית, מערכות בדרך כלל מורכבים של מספר עצום של חלקיקים, זה בלתי אפשרי כדי לקבוע את המאפיינים של כאלה מערכות מורכבות באופן אנליטי; MD סימולציה עוקפת את הבעיה הזו על ידי שימוש נומרית שיטות. עם זאת, זמן MD ההדמיות מתמטית השלישי-מותנה, יצירת מצטבר שגיאות אינטגרציה נומרית זה יכול להיות ממוזער עם בחירה נכונה של אלגוריתמים ואת הפרמטרים, אבל לא לחסל לגמרי.
עבור מערכות אשר לציית ergodic השערה, את האבולוציה של אחד מולקולרית דינמיקה סימולציה עשוי לשמש כדי לקבוע מאקרוסקופית תרמודינמי מאפיינים של המערכת: הזמן הממוצע של ergodic מערכת מתאימות microcanonical אנסמבל ממוצעים. MD יש גם מה שנקרא "מכניקה סטטיסטית על ידי מספרים" ו "Laplace's החזון של המכניקה הניוטונית" של חיזוי העתיד על-ידי הנפשת הטבע של כוחות[4][5] ולאפשר תובנה מולקולרית תנועה על אטומית קנה מידה.