Génotypage
De Wikipedia, l'encyclopédie encyclopedia
Le génotypage est la méthode d’acquisition de données permettant de déterminer l'identité d'une variation génétique, à une position spécifique sur tout ou partie du génome, pour un individu ou un groupe d'individus donné appartenant à une espèce animale, végétale, fongique... Il est effectué de manière standardisée et automatisée par des robots (robots de pipetage, robot extracteur d'ADN...), thermocycleurs, séquenceurs capillaires.
Parallèlement à de grands programmes visant à cartographier le génome entier de certaines espèces d'intérêt médical ou économique, les laboratoires utilisent, avec des résultats plus rapides, différentes techniques, dont :
- le génotypage Microsatellites SSR (simple sequence repeats)
- le génotypage de SNP (Single Nucleotide Polymorphisms)
- le génotypage ISBP (Insertion Site Based Polymorphisms)
- L'allélotypage, qui détermine les fréquences relatives des allèles...