Sauf précision contraire, les dates de cet article sont sous-entendues dans le calendrier grégorien.
L'histoire du Haut-Altaï est l'histoire de la région de Sibérie méridionale devenue sujet de la Russie sous le nom de république de l'Altaï. La région, qui fut longtemps connue comme le Haut-Altaï, d'après les montagnes de l'Altaï, fut probablement peuplée par des peuples paléo-Sibériens au Paléolithique supérieur, mais sa préhistoire reste encore mal connue. Après les Scythes dès le VIIIesiècleav. J.-C., de nombreux royaumes mongols puis turcs se sont succédé sur ce territoire montagneux. Des conquêtes de Gengis Khan jusqu'au XVIIIesiècle, le Haut-Altaï fut sous la domination de khanats mongols. Après la déroute du Khanat dzoungar face à la dynastie Qing lors des guerres Dzoungar-Qing, les chefs de tribu décidèrent de rejoindre l'empire russe, annexion faite le 21 juin 1756 (dans le calendrier grégorien). Le Haut-Altaï est ainsi la seule région sibérienne à avoir rejoint volontairement la Russie. Elle possède le statut de république depuis le .