Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère
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SARSr-CoV (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome-related coronavirus)[note 1] est le nom scientifique officiel de l'espèce[note 2] de coronavirus liés au syndrome respiratoire aigu sévère (soit également SL-CoV, pour SARS-like coronavirus). Ce sont, par exemple, le virus du SRAS de 2003 ou celui de la Covid-19. Les différentes formes de ces coronavirus infectent les humains, les chauves-souris et d'autres mammifères[3]. Il s'agit d'un virus à ARN simple brin de sens positif enveloppé qui pénètre dans sa cellule hôte en se liant au récepteur ACE2[4]. Il est membre du genre Betacoronavirus et du sous-genre Sarbecovirus[5],[6], différent de celui du coronavirus causant le MERS.
SARSr-CoV
Ne doit pas être confondu avec SARS-CoV ou SARS-CoV-2.
formes de rang inférieur
- SARS-CoV-1
- SARS-CoV-2
- Bat SL-CoV LYRa11
- Bat SL-CoV WIV1
- Bat SL-CoV RsSHC014
- Bat SL-CoV RaTG13
(…)
- Pangolin SL-CoV GD
- Cat SL-CoV
- Tiger SL-CoV
- Mink SL-CoV
- Dog SL-CoV[2]
Deux souches de SARSr-CoV ont provoqué des flambées de maladies respiratoires graves chez l'humain : le SARS-CoV, qui a provoqué une flambée de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) entre 2002 et 2003, et le SARS-CoV-2, qui depuis fin 2019 a provoqué une pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)[7],[8]. Il existe des centaines d'autres souches de SARSr-CoV, qui sont connues pour n'infecter que des espèces non humaines : les chauves-souris sont un réservoir majeur de nombreuses souches de SARSr-CoV, et plusieurs souches ont été identifiées dans les civettes de palmier, qui étaient les ancêtres probables du SARS-CoV[9].
Le SARSr-CoV était l'une des nombreuses espèces virales identifiées par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) en 2016 comme une cause probable d'une future épidémie dans un nouveau plan élaboré après l'épidémie d'Ebola pour la recherche et le développement urgents de tests de dépistage, vaccins et médicaments. La prédiction s'est réalisée avec la pandémie de Covid-19[10],[11].