44 נבחרות מאסיה היו אמורות להתחרות במוקדמות המונדיאל, אך קמבודיה, הפיליפינים, בהוטן וברוניי פרשו לפני תחילת המוקדמות, ומיאנמר הושעתה מהתחרות, כך שבפועל התחרו 39 נבחרות על 4.5 המקומות שהוקצו לאסיה לקראת מונדיאל 2006.
טורניר המוקדמות הורכב משלושה סבבים. 14 הנבחרות הנחותות מבחינת הדירוג העולמי של פיפ"א השתתפו בסיבוב מוקדם, בו חולקו לזוגות ושיחקו אחת נגד השנייה בשיטת בית-חוץ. 7 המנצחות העפילו ביחד עם 25 הנבחרות האחרות לסיבוב השני, בו חולקו הנבחרות ל-8 בתים בני 4 נבחרות כל אחד. הנבחרות בכל בית שיחקו אחת נגד השנייה בשיטת בית-חוץ, כשהנבחרת הראשונה בכל בית מעפילה לסיבוב השלישי.
בסיבוב השלישי חולקו 8 הנבחרות הנותרות לשני בתים בני 4 נבחרות כל אחד, ושיחקו אחת נגד השנייה בשיטת בית-חוץ. שתי הנבחרות הראשונות בכל בית העפילו למונדיאל. שתי הנבחרות שסיימו במקום השלישי שיחקו בפלייאוף אחת נגד השנייה בשיטת בית-חוץ. הנבחרת המנצחת בפלייאוף הזה העפילה לפלייאוף הבין-יבשתי נגד הנבחרת שסיימה במקום הרביעי בסיבוב הגמר של CONCACAF (צפון, מרכז אמריקה והקריביים).
סיבוב מוקדמות
טורקמניסטן העפילה לסיבוב השני.
הרפובליקה הסינית העפילה לסיבוב השני.
טג'יקיסטן העפילה לסיבוב השני.
סרי לנקה העפילה לסיבוב השני.
קירגיזסטן העפילה לסיבוב השני.
המלדיביים העפילה לסיבוב השני.
גואם ונפאל היו אמורות לשחק זו נגד זו, אך בעקבות פרישת נפאל העפילה גואם, שבתורה פרשה גם כן. פיפ"א החליטה לבחור מבין המפסידות נבחרת שתעפיל לסיבוב השני, ובחרה בלאוס שהייתה בעלת המאזן הטוב ביותר.
סיבוב שני
בית 1
איראן העפילה לסיבוב הגמר.
בית 2
אוזבקיסטן העפילה לסיבוב הגמר.
בית 3
יפן העפילה לסיבוב הגמר.
בית 4
כווית העפילה לסיבוב הגמר.
בית 5
מידע נוסף נבחרת, נקודות ...
סגירה
קוריאה הצפונית העפילה לסיבוב הגמר.
בית 6
בחריין העפילה לסיבוב הגמר.
בית 7
קוריאה הדרומית העפילה לסיבוב הגמר.
בית 8
ערב הסעודית העפילה לסיבוב הגמר.
סיבוב הגמר
בית 1
מידע נוסף נבחרת, נקודות ...
סגירה
ערב הסעודית וקוריאה הדרומית העפילו ישירות למונדיאל. אוזבקיסטן העפילה לפלייאוף היבשתי.
בית 2
יפן ואיראן העפילו ישירות למונדיאל. בחריין העפילה לפלייאוף היבשתי.
פלייאוף
בחריין העפילה לפלייאוף הבין יבשתי מול נציגת צפון, מרכז אמריקה והקריביים.