במתמטיקה, משוואה פונקציונלית היא משוואה שהנעלם שלה הוא פונקציה (בדרך כלל פונקציה ממשית). למשוואות המאפשרות הצבה של שני פרמטרים או יותר, כמו משוואת קושי , יש בדרך כלל פתרונות רציפים מעטים.
פונקציית זטא של רימן מקיימת את המשוואה הפונקציונלית , שיש לה חשיבות מהותית בהבנת הפונקציה (כאן גמא מייצג את פונקציית גמא, שבעצמה מקיימת כל אחת מן המשוואות ,
ו-).
- פונקציית הסינוס מקיימת את המשוואה .
- פונקציית הקוסינוס מקיימת את המשוואה
- את המשוואה מקיימת כל פונקציה מהצורה f(x)=x^a.
- את המשוואה מקיימת כל פונקציה מהצורה f(x)=a^x.
- המשוואה נקראת כלל המקבילית.